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表观基因组学技术
WGBS
WGBS
WGBS技术,全称为:Whole Genome Bisulfite Sequencing,2008年3月Shawn J. Cokus和Suhua Feng首次用WGBS对拟南芥全基因组甲基化水平进行了测定(Shawn J. Cokuset al., 2008),它是一种单碱基分辨率鉴定全基因组范围内DNA甲基化水平的技术。该技术主要通过对DNA样本进行亚硫酸盐处理,未甲基化的胞嘧啶(C)被亚硫酸盐转化为尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶则不受影响。转化后的DNA随后进行文库构建和高通量测序,通过比较处理后的DNA序列与参考基因组序列的差异,可以准确地定位和量化DN…
ChIP-Seq
ChIP-Seq
ChIP-Seq(染色质免疫沉淀测序)是一种强大的技术,用于研究蛋白质如转录因子和组蛋白修饰与DNA的相互作用。通过这种技术,研究人员能够全面理解基因表达的调控机制,揭示细胞内的分子事件和疾病发生的分子基础。本科研服务旨在为广大科研工作者提供高质量的ChIP-seq实验和数据分析服务,从而加速科研进展和成果的产出。一、服务介绍1. 实验设计咨询提供个性化实验设计方案,根据研究目的和样本类型选择最合适的ChIP-seq策略。确定目标蛋白质和相应的特异性抗体。2. 样本处理接收多种类…
CUT&Tag
CUT&Tag
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation, CUT&Tag)是一种研究蛋白质与DNA互作的新方法。该方法通过分子生物学手段将高活性的Tn5转座酶与Protein A融合,并装载建库接头引物形成pA-Tn5转座复合物。在抗体的引导下该pA-Tn5转座复合物可靶向切割目的蛋白附近的DNA序列。 与传统ChIP-Seq相比,该技术无需交联与超声打断操作,规避了抗原决定簇遮盖和样本损失问题,提高了信噪比,所需细胞量减少(可低至60个)。与CUT&Run相比,该技术在pA-Tn5转座复合物进行切割时…
ATAC-Seq
ATAC-Seq
ATAC-Seq技术,全称为:Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing),是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的一种用于研究染色质可及性(通常也理解为染色质的开放性)的方法(Buenrostro, Giresi, Zaba, Chang, & Greenleaf, 2013)。该方法通过超活化Tn5转座酶将序列接头插入到染色质开放区域,然后通过DNA测序数据分析推断染色质各区域的可及性、转录因子结合位点以及核小体位置。ATAC-Seq可以在全基因组范围…
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