HiChIP技术，全称为：in situ Hi-C followed by chromatin immunoprecipitation，由斯坦福大学Howard Chang实验室于2016年开发，并于《Nature Methods》上发表的一种用于研究（Mumbach et al., 2016）特定蛋白介导的全基因组DNA-DNA相互作用的技术。该技术首先进行细胞核内原位基因组DNA消化和邻近连接，再用特异的抗体富集目的蛋白介导的完成邻近连接的嵌合DNA分子，进而在全基因组范围内精确地识别目的蛋白的DNA顺式调控元件及其在三维空间中的组织方式。
HiChIP融合了Hi-C和ChIA-PET技术的优势，并借助转座酶介导的文库构建方法，在较低的数据量下实现更高分辨率的染色质三维结构解析。HiChIP技术凭借其高效、灵敏和低样本需求的特点，已成为研究染色质三维结构和基因调控机制的重要工具。
HiChIP技术，文库构建主要分为以下步骤：
1. 用甲醛铰链DNA和蛋白，目的是让可能存在相互影响的DNA片段连接；
2. 用超声等方法将DNA片段化；
3. 用特异性蛋白抗体富集DNA和蛋白复合物；
4. 在DNA片段末端加上包含MmeI位点的生物素化寡核苷酸linker；
5. 连接linker，从而形成连接目的DNA片段的桥梁；
6. 用限制性内切酶消化得到DNA片段，去除蛋白质；
7. 固定化PET序列；
8. 上机测序。
一、细胞样品
反应所需细胞应大于10million/管（每个样本准备2~3管），具体细节详询销售。
二、动物组织
选取新鲜组织，质量大于100mg/份，取样时剔除冗余部分，保证组织的单一性，建议取材后用生理盐水漂洗，以去除血渍和污物，液氮速冻，-80℃保存。建议样品制备 2~3 份。
三、植物组织
选取取幼嫩组织，如嫩叶，根尖，幼苗等，质量大于5g/份，建议取样后用清水漂洗去除污物，纸巾吸干水分后液氮速冻，-80℃保存。建议样品制备 2~3 份。
