WGBS技术,全称为:Whole Genome Bisulfite Sequencing,2008年3月Shawn J. Cokus和Suhua Feng首次用WGBS对拟南芥全基因组甲基化水平进行了测定(Shawn J. Cokuset al., 2008),它是一种单碱基分辨率鉴定全基因组范围内DNA甲基化水平的技术。该技术主要通过对DNA样本进行亚硫酸盐处理,未甲基化的胞嘧啶(C)被亚硫酸盐转化为尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶则不受影响。转化后的DNA随后进行文库构建和高通量测序,通过比较处理后的DNA序列与参考基因组序列的差异,可以准确地定位和量化DNA甲基化位点。
通过WGBS技术可深入理解甲基化在基因表达调控、生长发育以及疾病形成中的作用,是表观遗传学研究的高效工具。WGBS能为基因组DNA甲基化时空特异性修饰的研究提供重要技术支持,能广泛应用在个体发育、衰老和疾病等生命过程的机制研究中,也是各物种甲基化图谱研究的首选方法。
关于WGBS文库构建,主要分为以下几步:
1、高质量基因组DNA提取;
2、亚硫酸盐处理基因组DNA;
3、文库构建;
4、测序;
5、数据的生物信息分析,鉴定全某因组5mC位点。
